A terceira temporada gira em torno de Miguel que sai do Miguel fica paraplégico depois de uma briga violenta na escola e que chegou até correr risco de vida. Kreese manipula os seus alunos pela divisão dos seus mestres. Até que um dia Johnny Lawrence resolve sair do Cobra Kai e ter seus próprios alunos com outro nome em sua escola de Karate. O romance da Samantha e Miguel fica cada vez mais intenso. Robby começa um romance de altos e baixos com Tory Nichols. E a cada dia o romance de Johnny e Carmen aumenta cada vez mais. Uma boa temporada de vários romances e brigas onde o presente e o passado se misturam.