1. Gabinete de Segurança Institucional (GSI):

 O general Gonçalves Dias - general Marcos Antônio Amaro;

2. Direitos Humanos:

 Silvio Almeida (sem partido) - Macaé Evaristo (PT-MG);

3. Secretaria de Comunicação Social: 

Paulo Pimenta (PT-RS) saiu e foi substituído pelo publicitário Sidônio Palmeira;

4. Turismo: 

Daniela do Waguinho (ex-Republicanos, atual União-RJ) - Celso Sabino (União-PA);

5. Esportes: 

Ana Moser (sem partido) - André Fufuca (PP-MA);

6. Portos e Aeroportos: Silvio Costa Filho (Republicanos-PE) assumiu a past, Márcio França (PSB-SP) foi para o Ministério de Micro e Pequenas Empresas;
7. Justiça: Ricardo Lewandowski  - Flávio Dino, indicado por Lula para uma vaga no Supremo Tribunal Federal;
8. Saúde: Nísia Trindade - Alexandre Padilha (PT-SP);
9. Secretaria de Relações Instituições: Padilha - Saúde e foi substituído por Gleisi Hoffmann (PT-PR);
10. Comunicações: Juscelino Filho -Frederico de Siqueira Filho
11. Previdência Social: Carlos Lupi - Wolney Queiroz